Ma’had Aly (Pesantren Mahasiswa) STAI Al-Aqidah Al-Hasyimiyyah adalah program khusus bagi mahasiswa yang mengambil program sarjana Strata Satu (S1) sambil bermukim di asrama pesantren.

Mahasiswa yang juga menjadi santri di pesantren akan mendapatkan 2 Ijazah, yakni dari program studi yang diambil, juga dari program Ma’had yang diikutinya.

Ma’had Aly STAI Al-Aqidah Al-Hasyimiyyah memiliki Takhashus (Spesifikasi Keahlian) di bidang Penguasaan Lektur (Kajian Naskah) Islam Nusantara.

Mahasiswa yang bisa bergabung sebagai Santri Ma’had Aly diseleksi sesuai dengan ketentuan berlaku.